Analisis Keragaman Exon-1 Gen Hormon Pertumbuhan pada Itik Lokal (Bayang) Sumatera Barat Menggunakan Metoda PCR-RFLP

Sarbaini Sarbaini, Yurnalis Yurnalis, Hendri Hendri

Abstract

Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi polimorfisme BfmI ekson-1 gen hormon pertumbuhan itik Bayang. Sebanyak 100 sampel DNA genom diekstrak dari sampel darah individu itik. Prosedur PCR digunakan untuk mengamplifikasi fragmen ekson-1 gen hormon pertumbuhan sepanjang 801 bp menggunakan sepasang primer F: 5’-CTGGAGCAGGCAGGAAAATT-3’ dan R: 5’-TCCAGGGACAGTGACTCAAC-3’. DNA produk amplifikasi kemudian direstriksi menggunakan enzim restriksi BfmI. Hasil penelitian menunjukkan bahwa identifikasi keragaman itik Bayang menggunakan GH/BfmI bersifat monomorfik dengan frekuensi alel T adalah 1,00 dan frekuensi alel A adalah 0,00.

 Keywords

Itik Bayang; BfmI; exon-1; gen hormon pertumbuhan; keragaman

 Full Text:

PDF

References

Apriyantono, Anton. 2011. Pedoman Budidaya Itik Pedaging yang Baik. Jakarta: Gramedia.

Dirjen Peternakan dan Kesehatan Hewan, 2015. Produksi daging dan telur itik Sumatera Barat.

Falconer, D.S and T.F.C. Mackay. 1996. Introduction to Quantitative Genetic. 4th

Ed. Essex, England: Longman Group Ltd.

Hiyama, G., H. Okabayashi, N. Kansaku and K. Tanaka., 2012. Genetic Variation in the Growth Hormone Promoter Region of Anas platyrhynchos, a Duck Native to Myanmar. J. Poult. Sci., 49: 245-248.

Ip SCY, X. Zhang, and F.C. Leung. 2001. Genomic growth hormone gene polymorphism in native Duck. Expe. Biol. Med. 226 (6) 458-462.

Kaps, M. dan W.R. Lamberson. 2004. Biostatistic for Animal Science. UK: CABI Publishing.

Kashi, Y., E. Hallerman and M. Soller. 2003. Marker-assisted selection of candidate bull for progeny testing programmes. Anim Prod. 51 63

Kepmentan. 2012. Penetapan Rumpun Itik Bayang. Jakarta

Montaldo, H.H. and C.A.M. Herrera. 1998. Use of Molecular Markers and Major Genes in The Genetic Improvement of Livestock. EJB Unversidad Catolica de Valparaso-Chili.

Nei, M. 1987. Molecular Evalutionery Genetics. Columbia University Press, New York

Nei, M. and S. Kumar. 2000. Molecular Evolution and Genetics. Oxford University Press, New York.

Sole, X., E. Guino, J. Valls, R Iniesta and V. Morena. 2006. SNPstats: a web tool for the analysis of association studies. Bioinformatics Advance Access. 22:1928-1929.

Viljoen GJ , Nel LH, Crowther JR . 2005. Molecular d iagnostic PCR h andbook. Springer, Dordrecht, Netherland.

Warwick, E. J., J. M. Astuti dan W. Hardjosubroto. 1994. Pemuliaan Ternak. Edisi V. Gadjah Mada University Press, Yogyakarta.

Xu, S. H., W. B. Bao, and J. H. Cheng. 2007. Polymorphism analysis on coding and regulation regions of growth hormone gene in duck.–Acta Vet. Zootech. Sin. 38: 907 – 912.

DOI: https://doi.org/10.25077/jpi.20.2.124-129.2018

Refbacks

  • There are currently no refbacks.